mikropaleontologija (mikro- + paleontologija), grana paleontologije koja proučava mikrofosilne organizme, kao i dijelove većih fosilnih organizama. Najčešće se u izbruscima stijena proučavaju kućice vapnenačkih foraminifera, talusi vapnenačkih algâ, ostrakodi, iglice spužava, bodlje ježinaca i posve mali pužići, s pomoću stereoskopske lupe i mikroskopa. S pomoću mikrofosila određuje se istovjetnost horizonata i relativna starost sedimentnih naslaga, npr. u bušotinama koje se izvode radi pronalaženja nafte, ugljena, vode i u druge svrhe. Tada mikropaleontologija ima ekonomsko značenje kao primijenjena mikropaleontologija. Mikropaleontologija se bavi i analizom peluda i spora koji se vade iz treseta, ugljena ili mlađih, rahlih sedimenata. Ako je sediment tako čvrst da se mikrofosili iz njega ne mogu izvaditi, izrađuju se njegovi mikroskopski izbrusci, koji su potpuno prozirni pa se može vidjeti unutar. građa mnogih mikrofosila (npr. vapnenačkih alga, vapnenačkih foraminifera i dr.), građa i raspored u kolonijskim organizmima (koralji; Hydrozoa, Bryozoa), kao i građa pojedinih dijelova makrofosila (npr. stijenke izumrlih gornjokrednih školjkaša rudista i sl.).
